​Estas ações de patrulhamento e fiscalização no mar têm incidido especialmente sobre as várias Áreas Marinhas Protegidas, como a da baixa do Ambrósio, Ilhéu da Vila, baixa da Pedrinha e baixa da Maia, e incluindo também diversas idas à Reserva Natural dos Ilhéus das Formigas, com o objetivo de prevenir e combater a pesca em locais proibidos, preservando os recursos naturais existentes e verificando as condições de segurança das embarcações e do pessoal embarcado.

Releva-se também destas ações, para além das idas aos ilhéus das Formigas situados a grande distancia da ilha de Santa Maria, as missões de fiscalização no mar feitas pela Polícia Marítima, de forma dissimulada e com meios náuticos não convencionais, nas zonas de reserva mais próximas de terra, com o objetivo de procurar surpreender eventuais prevaricadores.