O capitão-de-mar-e-guerra Paulo Alexandre Rafael da Silva nasceu em Lisboa, em 10 de janeiro de 1970. Ingressou na Escola Naval em 1988, concluindo a Licenciatura em Ciências Militares-Navais – Ramo de Marinha em 1993.
Desempenhou diversas funções a bordo de unidades da Marinha, tendo sido navegador das fragatas “Comandante Hermenegildo Capelo" e “Álvares Cabral", havendo a destacar neste período a participação em várias exercícios e operações navais, conjuntos e combinados, desempenhando em diversas ocasiões as funções de navegador de força naval.
Foi instrutor de Cálculos Náuticos na Escola Naval e, numa nova comissão de embarque, foi navegador do N.R.P. “Sagres".
Prestou depois serviço no Instituto Hidrográfico, tendo exercido, na Direção Técnica, as funções de Chefe da Divisão de Navegação.
Frequentou o curso de mestrado em “Navigation Technologies", na Universidade de Nottingham (Reino Unido), o qual concluiu com mérito, tendo sido considerado o melhor aluno do curso em 2006, recebendo por isso o prémio de distinção do Royal Institute of Navigation.
Regressou ao mar em outubro de 2008 comandando o N.R.P. “António Enes". Ao leme desse navio efetuou duas comissões na Zona Marítima dos Açores, participou em diversos exercícios navais nacionais e internacionais, assim como em operações de combate ao narcotráfico, viagens de instrução de cadetes da Escola Naval e inúmeras missões de busca e salvamento e de fiscalização dos espaços marítimos nacionais.
Seguiu-se a frequência do Curso de Estado-maior Conjunto em 2010-11, no Instituto de Estudos Superiores Militares (hoje Instituto Universitário Militar - IUM), e, em 2011, uma pós-graduação em Estudos da Paz e da Guerra nas novas Relações Internacionais pela Universidade Autónoma de Lisboa.
Foi professor de Operações Navais, na Área de Ensino Específica de Marinha do IUM, no ano letivo 2011-12. Foi, depois, Chefe de Operações do Comando Operacional dos Açores entre 2012 e 2016.
Na Autoridade Marítima Nacional, assumiu, entre setembro de 2016 e janeiro de 2021, os cargos de Capitão do Porto e Comandante Local da Polícia Marítima da Horta e também de Santa Cruz das Flores, tendo esta comissão de serviço ficado marcada por significativos desafios, designadamente: o encalhe do navio “Mestre Simão", a passagem do furacão “Lorenzo", o apoio a outras forças de segurança, em ações que se traduziram na apreensão de cerca de duas toneladas de estupefacientes, o encerramento das fronteiras marítimas em 2020, no contexto de combate à pandemia de COVID-19, e várias ações de busca e salvamento na orla costeira. Entre janeiro e setembro de 2021 foi Capitão do Porto e Comandante Local da Polícia Marítima de Angra do Heroísmo e também da Praia da Vitória, passando depois a chefiar o Serviço de Inspeção e Auditoria da Direção-geral da Autoridade Marítima.
Entre julho de 2022 e setembro de 2024 exerceu os cargos de Capitão do Porto e Comandante Local da Polícia Marítima de Ponta Delgada e também de Vila do Porto, bem como os cargos de Segundo Comandante do Comando da Zona Marítima dos Açores e Adjunto do Chefe do Departamento Marítimo dos Açores.
O comandante Rafael da Silva foi auditor do Curso de Promoção a Oficial General no ano letivo 2024/25, tendo sido nomeado pelo Almirante Autoridade Marítima Nacional para atual cargo de Diretor da Escola da Autoridade Marítima em setembro de 2025.
Promovido ao atual posto em novembro de 2021, o capitão-de-mar-e-guerra Rafael da Silva tem diversos louvores e condecorações, acumulando na sua carreira naval cerca de 20 mil horas de navegação.